Katatonia est né de la rencontre entre Jonas Renkse et Blackheim en 1991. A l'époque, le duo souhaitait composer une musique sombre, mélancolique et intense émotionnellement. Pour cela, il se dirigea vers une sorte de dom-death mélancolique qui peut rappeler les premiers Opeth, dont Katatonia se sent proche. Les albums Dance of December Souls et Brave Murder Day (sur lequel chante Mikael Akerfeldt d'Opeth) forment l'héritage de la période death doom du groupe.

Katatonia s'orienta vers une toute autre direction sur les albums suivants. Jonas Renkse abandonna sa voix éraillée pour une voix claire, les compositions s'orientent vers un rock mélancolique, et le duo accueilla ses nouveaux membres (Fred Norrman, Daniel Liljekvist et Mattias Norrman). Discouraged Ones immortalisera alors ce revirement stylistique.

Puis sortirent les albums Tonights Decision, Last Fair Deal Gone Down, et Viva Emptiness, sur lesquels Katatonia peaufina encore son style: les guitares deviennent plus puissantes, contre-carrant le chant de Jonas qui devînt plus aérien.

En 2006, l'album The Great Cold Distance couronnera une carrière prometteuse. En effet, il permit à Katatonia une reconnaissance mondiale, ainsi que de nombreuses tournées.

L'année 2009 signe le retour du combo avec le huitième album Night Is The New Day. Plus progressive et toujours aussi sombre, la musique de Katatonia séduit de plus en plus d'amateurs de Metal sombre et mélancolique.
La fin de l'année 2009 se voit également marquée par le départ de Fred et Mattias Norrman, respectivement guitariste et bassiste. La raison évoquée: des indisponibilités pour les tournées à venir, les deux frères souhaitant avant tout profiter de leur famille.
Cette soudaine et inattendue séparation met fin à une longue période de dix années sans aucun changement de line-up.